- 辦公廳（對臺灣農業(yè)事務(wù)辦公室）
- 人事司
- 法規司
- 政策與改革司
- 發(fā)展規劃司
- 計劃財務(wù)司
- 鄉村產(chǎn)業(yè)發(fā)展司（農產(chǎn)品加工指導司）
- 農村社會(huì )事業(yè)促進(jìn)司
- 農村合作經(jīng)濟指導司
- 市場(chǎng)與信息化司
- 國際合作司
- 科技教育司（農業(yè)轉基因生物安全管理辦公室）
- 農產(chǎn)品質(zhì)量安全監管司
- 種植業(yè)管理司（農藥管理司）
- 畜牧獸醫局
- 漁業(yè)漁政管理局
- 農墾局
- 種業(yè)管理司
- 農業(yè)機械化管理司
- 農田建設管理司
- 機關(guān)黨委
- 離退休干部局
- 長(cháng)江流域漁政監督管理辦公室
- 農業(yè)農村部機關(guān)服務(wù)中心( 農業(yè)農村部機關(guān)服務(wù)局 )
- 中國農業(yè)科學(xué)院
- 中國水產(chǎn)科學(xué)研究院
- 中國熱帶農業(yè)科學(xué)院
- 全國農業(yè)展覽館（中國農業(yè)博物館）
- 中國農業(yè)電影電視中心
- 農民日報社
- 中國農業(yè)出版社（農村讀物出版社）
- 中國農村雜志社
- 中央農業(yè)干部教育培訓中心（農業(yè)農村部管理干部學(xué)院、中國共產(chǎn)黨農業(yè)農村部黨校）
- 農業(yè)農村部人力資源開(kāi)發(fā)中心、中國農學(xué)會(huì )
- 農業(yè)農村部農村經(jīng)濟研究中心
- 農業(yè)農村部信息中心
- 農業(yè)農村部農產(chǎn)品質(zhì)量安全中心（農業(yè)農村部?jì)?yōu)質(zhì)農產(chǎn)品開(kāi)發(fā)服務(wù)中心）
- 中國綠色食品發(fā)展中心
- 農業(yè)農村部規劃設計研究院
- 農業(yè)農村部大數據發(fā)展中心
- 農業(yè)農村部工程建設服務(wù)中心
- 農業(yè)農村部財會(huì )服務(wù)中心、中華農業(yè)科教基金會(huì )
- 農業(yè)農村部對外經(jīng)濟合作中心（中國-歐洲聯(lián)盟農業(yè)技術(shù)中心）
- 農業(yè)農村部農業(yè)貿易促進(jìn)中心(中國國際貿易促進(jìn)委員會(huì )農業(yè)行業(yè)分會(huì )、中國國際商會(huì )農業(yè)行業(yè)分會(huì ))
- 農業(yè)農村部國際交流服務(wù)中心
- 中央農業(yè)廣播電視學(xué)校(農業(yè)農村部農民科技教育培訓中心)、中國農民體育協(xié)會(huì )
- 農業(yè)農村部科技發(fā)展中心
- 農業(yè)農村部農業(yè)生態(tài)與資源保護總站
- 全國農業(yè)技術(shù)推廣服務(wù)中心
- 農業(yè)農村部農藥檢定所（國際食品法典農藥殘留委員會(huì )秘書(shū)處）
- 農業(yè)農村部耕地質(zhì)量監測保護中心
- 農業(yè)農村部農業(yè)機械化總站
- 全國畜牧總站
- 中國動(dòng)物疫病預防控制中心（農業(yè)農村部屠宰技術(shù)中心）
- 中國獸醫藥品監察所（農業(yè)農村部獸藥評審中心）
- 中國動(dòng)物衛生與流行病學(xué)中心
- 中國農墾經(jīng)濟發(fā)展中心（農業(yè)農村部南亞熱帶作物中心）
- 農業(yè)農村部農村社會(huì )事業(yè)發(fā)展中心（農業(yè)農村部鄉鎮企業(yè)發(fā)展中心）
- 全國水產(chǎn)技術(shù)推廣總站、中國水產(chǎn)學(xué)會(huì )
- 農業(yè)農村部漁政保障中心
- 外交部
- 國防部
- 國家發(fā)展和改革委員會(huì )
- 教育部
- 科學(xué)技術(shù)部
- 工業(yè)和信息化部
- 國家民族事務(wù)委員會(huì )
- 公安部
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- 退役軍人事務(wù)部
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- 國務(wù)院臺灣事務(wù)辦公室
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- 國務(wù)院新聞辦公室
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